Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAP2AP05549 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFAP2AP05549 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFAP2AP05549 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TFAP2AP05549 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms