Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK1P04629 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK1P04629 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK1P04629 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NTRK1P04629 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms