Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OPN1LWP04000 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPN1LWP04000 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OPN1LWP04000 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPN1LWP04000 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms