Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOEP02649 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOEP02649 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOEP02649 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOEP02649 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOEP02649 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
APOEP02649 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOEP02649 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOEP02649 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOEP02649 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOEP02649 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOEP02649 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOEP02649 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOEP02649 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOEP02649 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOEP02649 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOEP02649 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOEP02649 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOEP02649 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOEP02649 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOEP02649 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOEP02649 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOEP02649 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOEP02649 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOEP02649 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOEP02649 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOEP02649 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOEP02649 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOEP02649 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOEP02649 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APOEP02649 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOEP02649 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOEP02649 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOEP02649 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
APOEP02649 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOEP02649 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOEP02649 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APOEP02649 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOEP02649 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOEP02649 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOEP02649 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOEP02649 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOEP02649 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APOEP02649 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOEP02649 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
APOEP02649 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOEP02649 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOEP02649 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOEP02649 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOEP02649 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOEP02649 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOEP02649 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOEP02649 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOEP02649 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOEP02649 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOEP02649 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOEP02649 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOEP02649 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOEP02649 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOEP02649 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOEP02649 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOEP02649 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOEP02649 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOEP02649 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOEP02649 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOEP02649 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOEP02649 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOEP02649 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOEP02649 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOEP02649 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOEP02649 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOEP02649 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOEP02649 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOEP02649 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOEP02649 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOEP02649 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOEP02649 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOEP02649 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOEP02649 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOEP02649 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOEP02649 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOEP02649 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOEP02649 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOEP02649 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOEP02649 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms