Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTL6AO96019 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTL6AO96019 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTL6AO96019 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTL6AO96019 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms