Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN3O95197 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN3O95197 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN3O95197 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN3O95197 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN3O95197 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN3O95197 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN3O95197 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN3O95197 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN3O95197 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN3O95197 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RTN3O95197 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN3O95197 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN3O95197 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN3O95197 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN3O95197 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN3O95197 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN3O95197 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN3O95197 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN3O95197 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN3O95197 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN3O95197 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN3O95197 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN3O95197 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN3O95197 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN3O95197 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN3O95197 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN3O95197 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN3O95197 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN3O95197 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN3O95197 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN3O95197 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN3O95197 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN3O95197 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN3O95197 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN3O95197 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN3O95197 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN3O95197 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN3O95197 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN3O95197 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN3O95197 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN3O95197 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN3O95197 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN3O95197 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN3O95197 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN3O95197 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN3O95197 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN3O95197 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN3O95197 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN3O95197 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN3O95197 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN3O95197 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN3O95197 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN3O95197 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN3O95197 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN3O95197 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN3O95197 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN3O95197 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN3O95197 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN3O95197 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN3O95197 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN3O95197 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN3O95197 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTN3O95197 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTN3O95197 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN3O95197 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN3O95197 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN3O95197 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN3O95197 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN3O95197 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN3O95197 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN3O95197 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN3O95197 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN3O95197 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN3O95197 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN3O95197 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN3O95197 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN3O95197 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN3O95197 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN3O95197 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTN3O95197 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTN3O95197 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RTN3O95197 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTN3O95197 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTN3O95197 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTN3O95197 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTN3O95197 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTN3O95197 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTN3O95197 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTN3O95197 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTN3O95197 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms