Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSPG5O95196 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSPG5O95196 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSPG5O95196 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSPG5O95196 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms