Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DKK1O94907 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DKK1O94907 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DKK1O94907 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DKK1O94907 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DKK1O94907 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DKK1O94907 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DKK1O94907 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DKK1O94907 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK1O94907 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK1O94907 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK1O94907 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK1O94907 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DKK1O94907 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DKK1O94907 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DKK1O94907 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK1O94907 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK1O94907 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK1O94907 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKK1O94907 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKK1O94907 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKK1O94907 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKK1O94907 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKK1O94907 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKK1O94907 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKK1O94907 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DKK1O94907 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DKK1O94907 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DKK1O94907 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DKK1O94907 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DKK1O94907 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DKK1O94907 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DKK1O94907 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DKK1O94907 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DKK1O94907 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK1O94907 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK1O94907 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DKK1O94907 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DKK1O94907 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DKK1O94907 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DKK1O94907 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DKK1O94907 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DKK1O94907 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DKK1O94907 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK1O94907 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK1O94907 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK1O94907 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK1O94907 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK1O94907 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK1O94907 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK1O94907 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK1O94907 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK1O94907 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK1O94907 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DKK1O94907 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK1O94907 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKK1O94907 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DKK1O94907 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKK1O94907 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKK1O94907 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK1O94907 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK1O94907 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK1O94907 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK1O94907 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK1O94907 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK1O94907 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK1O94907 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKK1O94907 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKK1O94907 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKK1O94907 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKK1O94907 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DKK1O94907 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DKK1O94907 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DKK1O94907 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DKK1O94907 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DKK1O94907 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DKK1O94907 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK1O94907 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK1O94907 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK1O94907 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK1O94907 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK1O94907 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK1O94907 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK1O94907 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK1O94907 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK1O94907 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK1O94907 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK1O94907 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK1O94907 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK1O94907 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK1O94907 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK1O94907 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms