Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG12O94817 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG12O94817 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG12O94817 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG12O94817 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG12O94817 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG12O94817 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG12O94817 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG12O94817 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG12O94817 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG12O94817 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG12O94817 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG12O94817 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG12O94817 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG12O94817 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG12O94817 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG12O94817 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG12O94817 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG12O94817 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG12O94817 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG12O94817 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG12O94817 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG12O94817 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG12O94817 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG12O94817 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG12O94817 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG12O94817 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG12O94817 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG12O94817 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG12O94817 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG12O94817 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG12O94817 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG12O94817 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG12O94817 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG12O94817 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG12O94817 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG12O94817 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG12O94817 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG12O94817 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG12O94817 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG12O94817 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG12O94817 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG12O94817 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG12O94817 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG12O94817 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG12O94817 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG12O94817 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG12O94817 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG12O94817 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG12O94817 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG12O94817 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG12O94817 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG12O94817 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG12O94817 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG12O94817 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG12O94817 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG12O94817 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG12O94817 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG12O94817 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG12O94817 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG12O94817 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG12O94817 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG12O94817 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG12O94817 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG12O94817 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG12O94817 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG12O94817 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG12O94817 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG12O94817 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms