Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL3O75679 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL3O75679 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL3O75679 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms