Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SS18L1O75177 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SS18L1O75177 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SS18L1O75177 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms