Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC19A2O60779 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC19A2O60779 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC19A2O60779 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC19A2O60779 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms