Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSNA1O43805 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSNA1O43805 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSNA1O43805 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSNA1O43805 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSNA1O43805 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSNA1O43805 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSNA1O43805 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSNA1O43805 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSNA1O43805 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSNA1O43805 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms