Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGTAO43765 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGTAO43765 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGTAO43765 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGTAO43765 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGTAO43765 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGTAO43765 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGTAO43765 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGTAO43765 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGTAO43765 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGTAO43765 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SGTAO43765 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGTAO43765 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGTAO43765 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGTAO43765 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGTAO43765 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGTAO43765 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGTAO43765 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGTAO43765 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGTAO43765 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGTAO43765 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGTAO43765 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGTAO43765 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGTAO43765 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGTAO43765 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGTAO43765 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGTAO43765 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGTAO43765 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGTAO43765 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGTAO43765 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGTAO43765 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGTAO43765 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGTAO43765 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGTAO43765 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGTAO43765 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGTAO43765 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGTAO43765 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGTAO43765 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGTAO43765 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGTAO43765 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGTAO43765 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGTAO43765 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGTAO43765 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGTAO43765 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGTAO43765 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGTAO43765 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SGTAO43765 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGTAO43765 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SGTAO43765 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGTAO43765 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGTAO43765 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGTAO43765 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGTAO43765 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGTAO43765 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGTAO43765 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGTAO43765 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGTAO43765 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGTAO43765 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGTAO43765 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGTAO43765 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGTAO43765 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGTAO43765 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGTAO43765 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SGTAO43765 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGTAO43765 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGTAO43765 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGTAO43765 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGTAO43765 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGTAO43765 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGTAO43765 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGTAO43765 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGTAO43765 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGTAO43765 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGTAO43765 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGTAO43765 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGTAO43765 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGTAO43765 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGTAO43765 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGTAO43765 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGTAO43765 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGTAO43765 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGTAO43765 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGTAO43765 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGTAO43765 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGTAO43765 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGTAO43765 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGTAO43765 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGTAO43765 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGTAO43765 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGTAO43765 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGTAO43765 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms