Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRY3O43610 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPRY3O43610 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPRY3O43610 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPRY3O43610 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SPRY3O43610 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms