Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OIP5O43482 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OIP5O43482 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OIP5O43482 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OIP5O43482 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OIP5O43482 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OIP5O43482 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OIP5O43482 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OIP5O43482 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OIP5O43482 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OIP5O43482 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OIP5O43482 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OIP5O43482 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OIP5O43482 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OIP5O43482 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OIP5O43482 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OIP5O43482 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OIP5O43482 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OIP5O43482 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OIP5O43482 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OIP5O43482 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OIP5O43482 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OIP5O43482 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OIP5O43482 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OIP5O43482 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OIP5O43482 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OIP5O43482 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OIP5O43482 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OIP5O43482 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OIP5O43482 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OIP5O43482 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OIP5O43482 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OIP5O43482 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OIP5O43482 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OIP5O43482 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OIP5O43482 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OIP5O43482 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OIP5O43482 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OIP5O43482 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OIP5O43482 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OIP5O43482 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OIP5O43482 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OIP5O43482 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OIP5O43482 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OIP5O43482 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OIP5O43482 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OIP5O43482 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OIP5O43482 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OIP5O43482 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OIP5O43482 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OIP5O43482 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OIP5O43482 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OIP5O43482 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OIP5O43482 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OIP5O43482 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OIP5O43482 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OIP5O43482 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OIP5O43482 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OIP5O43482 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OIP5O43482 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OIP5O43482 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OIP5O43482 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OIP5O43482 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OIP5O43482 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OIP5O43482 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OIP5O43482 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OIP5O43482 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OIP5O43482 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OIP5O43482 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OIP5O43482 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OIP5O43482 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OIP5O43482 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OIP5O43482 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OIP5O43482 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OIP5O43482 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OIP5O43482 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OIP5O43482 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OIP5O43482 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OIP5O43482 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms