Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFS4O43181 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFS4O43181 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFS4O43181 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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