Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP290O15078 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP290O15078 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP290O15078 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP290O15078 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP290O15078 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP290O15078 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP290O15078 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP290O15078 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP290O15078 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP290O15078 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP290O15078 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP290O15078 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP290O15078 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP290O15078 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP290O15078 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP290O15078 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP290O15078 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP290O15078 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP290O15078 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP290O15078 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP290O15078 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP290O15078 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP290O15078 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP290O15078 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP290O15078 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP290O15078 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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