Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP290O15078 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CEP290O15078 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP290O15078 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP290O15078 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP290O15078 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP290O15078 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP290O15078 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP290O15078 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP290O15078 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP290O15078 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP290O15078 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP290O15078 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CEP290O15078 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP290O15078 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP290O15078 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP290O15078 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP290O15078 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP290O15078 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP290O15078 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP290O15078 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP290O15078 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP290O15078 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP290O15078 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP290O15078 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP290O15078 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP290O15078 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP290O15078 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP290O15078 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP290O15078 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP290O15078 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP290O15078 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP290O15078 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP290O15078 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP290O15078 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP290O15078 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP290O15078 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP290O15078 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP290O15078 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP290O15078 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms