Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRTO14522 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRTO14522 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRTO14522 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRTO14522 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRTO14522 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
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