Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXLO00592 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PODXLO00592 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXLO00592 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXLO00592 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXLO00592 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PODXLO00592 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXLO00592 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXLO00592 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PODXLO00592 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PODXLO00592 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PODXLO00592 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PODXLO00592 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PODXLO00592 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PODXLO00592 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PODXLO00592 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PODXLO00592 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PODXLO00592 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXLO00592 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXLO00592 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PODXLO00592 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXLO00592 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXLO00592 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PODXLO00592 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PODXLO00592 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PODXLO00592 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PODXLO00592 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PODXLO00592 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PODXLO00592 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PODXLO00592 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PODXLO00592 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PODXLO00592 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXLO00592 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PODXLO00592 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PODXLO00592 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXLO00592 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXLO00592 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PODXLO00592 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PODXLO00592 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PODXLO00592 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXLO00592 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PODXLO00592 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXLO00592 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXLO00592 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXLO00592 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXLO00592 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXLO00592 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXLO00592 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXLO00592 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXLO00592 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXLO00592 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PODXLO00592 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PODXLO00592 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXLO00592 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXLO00592 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXLO00592 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXLO00592 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXLO00592 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXLO00592 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXLO00592 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXLO00592 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXLO00592 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXLO00592 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXLO00592 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXLO00592 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXLO00592 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXLO00592 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXLO00592 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXLO00592 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXLO00592 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXLO00592 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXLO00592 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXLO00592 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXLO00592 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXLO00592 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PODXLO00592 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms