Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9YO00507 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP9YO00507 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP9YO00507 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP9YO00507 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP9YO00507 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP9YO00507 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9YO00507 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9YO00507 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9YO00507 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9YO00507 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9YO00507 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9YO00507 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9YO00507 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9YO00507 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9YO00507 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9YO00507 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9YO00507 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP9YO00507 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9YO00507 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9YO00507 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9YO00507 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9YO00507 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9YO00507 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9YO00507 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9YO00507 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9YO00507 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9YO00507 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9YO00507 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9YO00507 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9YO00507 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9YO00507 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9YO00507 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9YO00507 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9YO00507 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9YO00507 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9YO00507 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9YO00507 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9YO00507 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9YO00507 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9YO00507 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9YO00507 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9YO00507 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9YO00507 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP9YO00507 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP9YO00507 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP9YO00507 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9YO00507 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9YO00507 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9YO00507 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9YO00507 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9YO00507 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9YO00507 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9YO00507 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP9YO00507 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP9YO00507 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9YO00507 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9YO00507 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9YO00507 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9YO00507 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9YO00507 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9YO00507 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9YO00507 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9YO00507 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9YO00507 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9YO00507 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9YO00507 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9YO00507 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9YO00507 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9YO00507 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9YO00507 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9YO00507 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9YO00507 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9YO00507 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9YO00507 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9YO00507 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9YO00507 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9YO00507 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9YO00507 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9YO00507 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9YO00507 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9YO00507 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9YO00507 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9YO00507 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9YO00507 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9YO00507 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9YO00507 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9YO00507 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9YO00507 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9YO00507 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP9YO00507 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP9YO00507 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP9YO00507 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms