Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3BRM9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3BRM9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3BRM9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3BRM9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3BRM9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3BRM9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3BRM9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3BRM9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3BRM9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3BRM9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3BRM9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H3BRM9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H3BRM9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3BRM9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3BRM9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3BRM9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3BRM9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3BRM9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H3BRM9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H3BRM9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H3BRM9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H3BRM9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H3BRM9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H3BRM9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H3BRM9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H3BRM9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H3BRM9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H3BRM9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H3BRM9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H3BRM9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H3BRM9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H3BRM9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H3BRM9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H3BRM9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H3BRM9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H3BRM9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H3BRM9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H3BRM9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H3BRM9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H3BRM9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H3BRM9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H3BRM9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H3BRM9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H3BRM9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H3BRM9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H3BRM9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H3BRM9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H3BRM9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H3BRM9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H3BRM9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H3BRM9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H3BRM9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3BRM9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3BRM9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3BRM9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H3BRM9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H3BRM9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H3BRM9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3BRM9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3BRM9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3BRM9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H3BRM9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3BRM9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3BRM9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3BRM9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3BRM9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3BRM9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H3BRM9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H3BRM9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3BRM9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3BRM9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3BRM9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms