Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BMQ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BMQ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BMQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BMQ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BMQ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BMQ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BMQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BMQ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BMQ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BMQ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BMQ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BMQ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BMQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BMQ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BMQ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BMQ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BMQ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BMQ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BMQ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BMQ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BMQ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BMQ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BMQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BMQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BMQ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BMQ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BMQ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BMQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BMQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BMQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BMQ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BMQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BMQ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BMQ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BMQ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BMQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BMQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BMQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BMQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BMQ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BMQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BMQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BMQ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BMQ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BMQ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BMQ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BMQ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BMQ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BMQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BMQ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BMQ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BMQ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BMQ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BMQ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BMQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BMQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BMQ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BMQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BMQ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BMQ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BMQ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BMQ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BMQ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BMQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BMQ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BMQ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BMQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BMQ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BMQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BMQ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BMQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BMQ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BMQ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BMQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BMQ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BMQ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BMQ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BMQ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BMQ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BMQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BMQ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BMQ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BMQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BMQ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BMQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BMQ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BMQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BMQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BMQ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BMQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BMQ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BMQ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BMQ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BMQ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BMQ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BMQ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BMQ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BMQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BMQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms