Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERVV-2B6SEH9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERVV-2B6SEH9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ERVV-2B6SEH9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERVV-2B6SEH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERVV-2B6SEH9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVV-2B6SEH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVV-2B6SEH9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ERVV-2B6SEH9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ERVV-2B6SEH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ERVV-2B6SEH9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ERVV-2B6SEH9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms