Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP29-1A8MX34 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms