Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KNCNA6PVL3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KNCNA6PVL3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms