Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA6L3A6NEY3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA6L3A6NEY3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA6L3A6NEY3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLGA6L3A6NEY3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA6L3A6NEY3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L3A6NEY3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA6L3A6NEY3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA6L3A6NEY3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms