Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM43BA6NCK2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM43BA6NCK2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM43BA6NCK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM43BA6NCK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms