Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC144AA2RUR9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC144AA2RUR9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC144AA2RUR9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC144AA2RUR9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CCDC144AA2RUR9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC144AA2RUR9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC144AA2RUR9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms