Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBASA2RRP1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBASA2RRP1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBASA2RRP1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NBASA2RRP1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms