Protein–RNA interactions for Protein: A0PK00

TMEM120B, Transmembrane protein 120B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM120BA0PK00 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM120BA0PK00 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM120BA0PK00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM120BA0PK00 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM120BA0PK00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM120BA0PK00 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM120BA0PK00 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM120BA0PK00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM120BA0PK00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM120BA0PK00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM120BA0PK00 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM120BA0PK00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms