Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TTC26A0AVF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC26A0AVF1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC26A0AVF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
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