Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6Q4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A075B6Q4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms