Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6Q4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A075B6Q4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A075B6Q4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A075B6Q4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A075B6Q4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A075B6Q4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A075B6Q4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms