Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSGALNACT1-201ENST00000332246 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGEF3-201ENST00000296315 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF417-201ENST00000312026 3597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACTBP13-201ENST00000423971 3959 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDH8-211ENST00000584337 3986 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTGS1-203ENST00000373698 4987 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPIN3-218ENST00000639007 4277 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 BBS9-201ENST00000242067 4027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE3B-207ENST00000537063 3600 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLP1-223ENST00000621218 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms