Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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USP53Q70EK8 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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USP53Q70EK8 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP53Q70EK8 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP53Q70EK8 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP53Q70EK8 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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