Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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