Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANO2-211ENST00000546188 3702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF2-215ENST00000636488 3908 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSC-AS1-201ENST00000457356 4220 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXD2-202ENST00000409014 3404 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLCH1-204ENST00000460012 6413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFYA-201ENST00000341376 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC124804.1-202ENST00000583712 4315 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 U3.33-201ENST00000408117 204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELSR3-AS1-201ENST00000421275 196 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL450311.1-201ENST00000434931 576 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRB4-202ENST00000445719 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012307.1-201ENST00000449242 197 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV2D-18-201ENST00000519785 375 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL10P9-201ENST00000522551 645 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087289.3-203ENST00000587556 550 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009053.4-201ENST00000614366 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARP8-219ENST00000514067 2829 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 THADA-205ENST00000404790 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms