Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms