Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U3KQ87 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQ87 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQ87 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms