Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms