Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGEF2Q9Y6D5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms