Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX13Q9Y5W8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SNX13Q9Y5W8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX13Q9Y5W8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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