Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP15Q9Y4E8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms