Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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HCN4Q9Y3Q4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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HCN4Q9Y3Q4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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HCN4Q9Y3Q4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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HCN4Q9Y3Q4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HCN4Q9Y3Q4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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