Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms