Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG6Q9Y2V7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms