Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX6Q9UNH7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms