Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms