Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DENND2AQ9ULE3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2AQ9ULE3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms