Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms